根据《中华人民共和国劳动法》和《职业病防治法》，用人单位有义务对员工进行入职体检，以保障员工的身体健康和安全。因此，代替入职体检是违法的。

入职体检是用人单位在招聘新员工时的必要程序之一，其目的是确保新员工的身体健康状况符合用人单位的要求，避免因员工健康问题而引发的劳动争议和经济损失。如果用人单位不进行入职体检，可能会导致员工在工作中出现健康问题，甚至可能引发职业病，对员工的身体健康和用人单位的利益都会造成不良影响。

因此，代替入职体检是违法的，用人单位应该严格按照相关法律法规和规定进行入职体检，确保员工的身体健康和安全。如果用人单位违反相关法律法规和规定，可能会面临法律责任和赔偿责任。