代替体检是指个人或单位通过非法手段进行的体检，可能存在伪造、篡改或隐瞒体检结果等违法行为。如果被发现代替体检，处理流程如下：

1.立案调查：相关部门会对涉嫌代替体检的个人或单位进行立案调查，收集证据，了解情况。

2.召开听证会：相关部门会根据调查结果，召开听证会，听取涉事人员的陈述和辩解，进一步确认事实。

3.处理结果：根据听证会结果，相关部门会对代替体检的个人或单位进行处理。处理方式可能包括罚款、吊销执照、撤销资质等。

4.公示通报：相关部门会将代替体检的个人或单位的处理结果进行公示通报，以警示其他单位和个人不要进行类似违法行为。

5.刑事追究：如果代替体检的行为涉及到犯罪，相关部门会将其移交司法机关进行刑事追究。

总之，代替体检是一种严重的违法行为，如果被发现，会受到相应的法律制裁。因此，建议个人和单位遵守相关法律法规，不要进行代替体检等违法行为。